Deze soort houdt zich voornamelijk op in de Igapó. Dit is een verzamelnaam voor dat deel van de jungle dat het grootste deel van het jaar onder water staat. Vanaf ongeveer september valt een deel van dit gebied tijdelijk droog. Ook de moerasachtige gebieden die hieraan grenzen zijn deel van het verspreidingsgebied van de kaaimanteju. Ruwweg zou je dus kunnen stellen dat deze hagedissensoort zich ophoudt in de laaglandgedeeltes in de omgeving van de rivier de Amazone of een van haar talloze zijrivieren.
De biotoop waarin de kaaimanteju´s leven is dus erg waterrijk, maar eveneens weelderig begroeid.
Gedurende de dag schijnen ze voornamelijk in het water te blijven, maar ´s nachts kruipen ze ook wel "op het droge" om een schuilplaats te zoeken.
Kaaimanteju´s zijn goede klimmers en worden ook wel in bomen en struiken aangetroffen.